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Voy a hablar de las herramientas que considero imprescindibles para un desarrollador Java, en concreto para desarrollo J2EE. Puede que alguna se pueda obviar, como por ejemplo, Maven, pero la verdad es que yo no puedo vivir sin él. No incluyo en la lista la maquina virtual, es obvio que sin eso no puedes hacer nada:
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Lo primero es un IDE. Yo uso el Eclipse, que es el mas extendido, es opensource y es el que mas plugins tiene. Yo aconsejo descargarlo desde este enlace. Es una aplicacion web que te permite crearte tu propio paquete de plugins y descargarlo todo en un zip. Es muy útil para trabajar en un proyecto en equipo, ya que puedes distribuir ese zip entre los programadores, y te ahorras tiempo instalando los plugins desde el propio IDE. Otras opciones son Netbeans de Oracle (antes de SUN) o el premiado Intellij IDEA. Este último es comercial, aunque tienen edición community.
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